Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms