Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek9Q8K1R7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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