Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tcerg1Q8CGF7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcerg1Q8CGF7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms