Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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