Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms