Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nsun3Q8CCT7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nsun3Q8CCT7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms