Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Atg4aQ8C9S8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Atg4aQ8C9S8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Atg4aQ8C9S8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Atg4aQ8C9S8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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