Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M4

Gm5111, Predicted gene 5111, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5111Q8C9M4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5111Q8C9M4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms