Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms