Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stbd1Q8C7E7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms