Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubqln3Q8C5U9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubqln3Q8C5U9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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