Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms