Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms