Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T0

Xkr8, XK-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr8Q8C0T0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xkr8Q8C0T0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr8Q8C0T0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xkr8Q8C0T0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms