Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms