Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms