Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q8BGC1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q8BGC1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q8BGC1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms