Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krr1Q8BGA5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms