Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim65Q8BFW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms