Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Atg4cQ811C2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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