Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms