Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Stk35Q80ZW0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Stk35Q80ZW0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stk35Q80ZW0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Stk35Q80ZW0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Stk35Q80ZW0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Stk35Q80ZW0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Stk35Q80ZW0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Stk35Q80ZW0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms