Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm5bQ80Y84 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms