Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms