Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc155Q80VJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc155Q80VJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms