Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll4Q80V24 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms