Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sestd1Q80UK0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sestd1Q80UK0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sestd1Q80UK0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sestd1Q80UK0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms