Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms