Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms