Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms