Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms