Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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