Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms