Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms