Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms