Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hsh2dQ6VYH9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hsh2dQ6VYH9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms