Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rhox8Q6VSS7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms