Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms