Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms