Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gramd2bQ6PEM6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms