Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfrlQ6PE55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfrlQ6PE55 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms