Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sarm1Q6PDS3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sarm1Q6PDS3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sarm1Q6PDS3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms