Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms