Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms