Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms