Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp2d40Q6P8N9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms