Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snrnp200Q6P4T2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms