Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms