Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad17Q6NXW6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms