Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr44Q6NVE8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms